Храм имеет свою историю, первое упоминание о нем датируется 1589 годом. В начале ХVII века село Нахабино было разорено литовцами, и стало пустошью. Вновь прибывшие крестьяне уже 17 веке году соорудили для себя здесь деревянную церковь во имя Покрова Пресвятой Богородицы. В 1866 году на месте деревянной церкви появилось каменное строение в византийском стиле. С 1891 года при Священнике отце Сергие Пермском началось зарождение знаменитого Паломнического центра в Нахабине и Общества трезвости о котором и по сей день ходят легенды. Покровский храм был разрушен до основания в 1930 г. и сейчас на его месте снова стоит деревянная церковь и требуется восстановление.